La nutria de rio Lontra longicaudis se considera como un indicador del estado de conservación de los ecosistemas y normalmente se asocia principalmente a cuencas de ríos con aguas claras. Para que la especie pueda habitar cuerpos de agua dulce, de forma permanente, éstos tienen que tener cierto nivel de conservación. En este sentido es esencial que dispongan de suficientes refugios donde esconderse, descansar y reproducirse, lo que también es un indicador de las condiciones de los cuerpos de agua en el APFF Cerro Mohinora.
Esta especie se alimenta principalmente de peces, crustáceos y moluscos y son consumidoras oportunistas de pequeños mamíferos, aves, reptiles, insectos e inclusive frutos.
En la legislación mexicana, se encuentra en la categoría de amenazada de acuerdo a la NOM-059-SEMARNAT-2010 ya que sus poblaciones han sido seriamente afectadas en algunas zonas, por factores como la cacería, destrucción de su hábitat y contaminación de las aguas; por lo que es importante seguir obteniendo registros sobre la abundancia de las mismas y las zonas de mayor uso, para tomar las medidas necesarias en pro de la conservación de la especie.
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